Data přístupná prostřednictvím sítě GBIF jsou pro všechny zdarma, ale ne bez závazků. Podle podmínek smlouvy s uživateli dat GBIF uživatelé, kteří si stáhnou jednotlivé datové sady, nebo výsledky vyhledávání a použijí je ve výzkumu, nebo politice, souhlasí s jejich citováním pomocí DOI neboli identifikátoru digitálního objektu.
Správné citační postupy zajišťují vědeckou transparentnost a reprodukovatelnost tím, že vedou ostatní výzkumné pracovníky k původním zdrojům informací. Odměňují také instituce a jednotlivce publikující data tím, že posilují hodnotu sdílení otevřených dat a prokazují jejich dopad zúčastněným stranám a sponzorům. Datové soubory zveřejněné prostřednictvím GBIF jsou autorské elektronické datové publikace a jako s takovými by se s nimi mělo zacházet jako s prvotřídními výzkumnými výstupy a měly by být správně citovány.
Přestože jsou všechny níže uvedené příklady citací formátovány v harvardském stylu, přizpůsobte je prosím formátu vyžadovanému vaší institucí, vydavatelem, nebo agenturou. Uveďte však každý prvek obsahu - především DOI vyjádřený jako URL.
Citace dat
- Stažení dat o výskytu
- Jednotlivé datové sady
- Druhové stránky
- Odvozené datové sady
- Údaje o výskytu získané pomocí nástrojů třetích stran (např. rgbif, pygbif, spocc, dismo atd.)
- Údaje o výskytu přístupné prostřednictvím rozhraní API pro vyhledávání výskytů GBIF
- Údaje o událostech zpřístupněné v prostředí cloud computingu
Citování nedatového obsahu
Stažení dat o výskytu
Při stahování dat ze stránek GBIF.org je registrovaný uživatel okamžitě přesměrován na stránku, která obsahuje následující informace:
Tato citace se znovu objeví v potvrzovacím e-mailu zaslaném registrovanému uživateli. Tento odkaz mějte nablízku, abyste jej mohli citovat. Podrobnosti o předchozích staženích jsou vždy k dispozici v seznamu stažených souborů registrovaného uživatele. Pokud potřebujete pomoc s nalezením předchozího stažení, kontaktujte prosím GBIF.
Stránka pro stažení obsahuje záznam se seznamem všech přispívajících datových sad a přehled všech vyhledávacích výrazů, filtrů a faset. Uživatelé mohou rychle aktualizovat výsledky vyhledávání ze stránky pro stahování a uvidí také odkazy na všechny citace, jakmile budou zachyceny v programu GBIF pro sledování literatury(například).
Citování filtrovaných stažení
Pokud jste stažená data výrazně filtrovali, můžete vytvořit odvozenou datovou sadu, která bude obsahovat pouze záznamy použité v následné analýze. To vyžaduje, abyste během kroků filtrování zachovali sloupec datasetKey.
Citace více stažení
Pokud jste použili více souborů ke stažení, je možné, že do seznamu odkazů v článku nebudete moci uvést všechny citace. V takovém případě doporučujeme připojit doplňkový seznam nebo dodatek všech použitých souborů ke stažení. Kombinovaná data můžete také shrnout pomocí odvozené datové sady. Všimněte si, že systém GBIF umožňuje stahování více taxonů(až 100 000) v rámci jedné žádosti o stažení.
Jednotlivé datové sady
Většina souborů ke stažení z GBIF.org obsahuje záznamy z více datových sad (jak je uvedeno výše), ale v některých případech, jako je interní výkaznictví nebo předběžné zveřejnění datové sady pro výzkum, mohou uživatelé chtít nebo potřebovat citovat jedinou datovou sadu, jako v tomto příkladu:
Rivas Pava M D P, Muñoz Lara D G, Ruiz Camayo M A, Fernández Trujillo L F, Muñoz Castro F A, Pérez Muñoz N (2017). Colección Mastozoológica del Museo de Historia Natural de la Universidad del Cauca. Verze 1.1. Universidad del Cauca. Datová sada o výskytu https://doi.org/10.15472/ciasei přístupná prostřednictvím GBIF.org dne 2020-03-02.
Jelikož se datové sady mohou v průběhu času měnit, jsou i jednotlivým staženým datovým sadám přidělovány nové, jedinečné DOI, které by se měly používat v citacích. Pokud je to vhodné, lze to provést v kombinaci s citací původní datové sady, např.:
[Zpět nahoru](#top)Telenius A, Jonsson C (2017). Měkkýši Přírodovědného muzea v Göteborgu (GNM). GBIF-Sweden. Stažení datové sady o výskytu https://doi.org/10.15468/dl.f14yjv přístupné prostřednictvím GBIF.org dne 2020-03-02.
Druhové stránky
Každá stránka s druhem obsahuje výchozí citaci, například:
Sekretariát GBIF: Páteřní taxonomie GBIF. https://doi.org/10.15468/39omei Přístupné přes https://www.gbif.org/species/5284517
[13. ledna 2020].
Poznámka: Pokud činíte tvrzení o rozšíření daného taxonu, zvažte umožnit stažení výskytu. Tím se zajistí trvalý snímek s časovým razítkem a DOI, který lze citovat stejným způsobem jako stažená data o výskytu.
Odvozené datové sady
Odvozené datové soubory jsou citovatelné záznamy dat o výskytu zprostředkovaných GBIF, které pocházejí buď z:
- stahování z GBIF.org, které bylo výrazně filtrováno/omezeno, nebo
- data zpřístupněná v prostředí cloud computingu nebo
- data získaná jakýmkoli způsobem, pro který nebyl přidělen DOI, ale je vyžadován (např. nástroje třetích stran přistupující k vyhledávacímu rozhraní API GBIF)
Odvozené datové sadě je po vytvoření přiřazen jedinečný DOI, který lze použít k citování dat. Chcete-li vytvořit odvozenou datovou sadu, musíte se ověřit pomocí účtu GBIF.org a poskytnout seznam datových sad GBIF (podle DOI nebo datasetKey), ze kterých data pocházejí, ideálně s počtem záznamů, které jednotlivé datové sady poskytly.
Data GBIF zpřístupněná pomocí nástrojů třetích stran (např. rgbif, pygbif, spocc, dismo atd.)
Přístup k datům o výskytu z GBIF v jazycích R, Python a dalších programovacích jazycích je rychlý a snadný. Je však důležité mít stále na paměti, že požadavky na citace uvedené v dohodě s uživateli dat GBIF stále platí.
Pro většinu uživatelů se důrazně doporučuje získávat data o výskytu pomocí funkce occ_download() balíčku rgbif, protože se tím zajistí, že staženým datům budou přiřazeny DOI pro snadné citování.
Nástroje vracející výsledky přímo z rozhraní API pro vyhledávání GBIF (např. spocc, dismo a funkce occ_data() a occ_search() v rgbif) nebudou přiřazovat jednotlivá DOI pro stažená data. Je na uživateli, aby identifikoval vydavatele datových sad a řádně je uvedl při citování dat.
U dat získaných prostřednictvím nástrojů API pro vyhledávání výskytů doporučujeme použít odvozenou datovou sadu jako snadný způsob získání DOI pro citování dat. Na stránkách dokumentace rOpenSci jsou uvedeny pokyny, jak citovat data zprostředkovaná GBIF v rgbif.
Cloudová prostředí
GBIF zpřístupňuje měsíční snímky dat o výskytu pro analýzu v řadě prostředí cloud computingu:
Uživatelé, kteří přistupují k datům a/nebo je analyzují v takovém cloudovém prostředí, by se měli řídit konkrétními pokyny uvedenými v úložištích cloud computingu. Do citace uveďte minimálně DOI příslušného snímku (viz tabulka). U analýz, kde jsou data výrazně filtrována, sledujte použité datasetKeys a pro citování dat použijte odvozený záznam datasetu.
Citování obsahu GBIF, který není datový
GBIF.org
Ti, kteří chtějí citovat webové stránky GBIF obecně, mohou použít následující příklad:
GBIF.org (rok), Domovská stránka GBIF. Dostupné z: https://www.gbif.org
[13. ledna 2020].
Autorský obsah na GBIF.org (webová stránka)
Stejně tak mohou uživatelé citovat stránky, které neobsahují data, na webových stránkách GBIF jako např.:
GBIF.org (rok) Pokyny pro citace. Dostupné z: https://www.gbif.org/citation-guidelines
[13. ledna 2020].
Poznámka: tento přístup není přijatelnou alternativou pro citování stažených dat.
GBIF jako infrastruktura/subjekt
Těm, kteří chtějí citovat GBIF v širším, obecnějším kontextu, doporučujeme použít následující citaci:
GBIF: Globální nástroj pro informace o biologické rozmanitosti (rok) Co je GBIF?. Dostupné z: https://www.gbif.org/what-is-gbif
[13. ledna 2020].